斜视眼有家族遗传性。若调查斜视患儿的家族史，会发现家族成员中患有斜视的人（如兄弟、姊妹、叔伯、姑姨之中）甚多。
关于身体方面的各种缺陷能够遗传是众所周知的事，但这种遗传基因不尽然都遗传给每个儿女。兄弟之中可能只有一人患斜视，另一人则眼位端正。这个眼位端正的兄弟结了婚，有了孩子，也可能会有患斜视的子女。斜视眼在家族中遗传不是全体成员，这种缺陷往往是间接遗传到下一代子女身上，在遗传学上对这个问题研究的已经比较清楚了。
电子视力检测仪厂家认为，如果有眼肌先天性异常，包括眼外肌本身发育异常，中胚叶分化不全，眼肌分离不良，眼肌附着处异常，肌鞘异常及纤维化（如上斜肌腱鞘综合征）等解剖上的缺陷，或一眼眼肌功能过强，另一组拮抗肌弹性减弱，运动性障碍等，皆可妨障两眼眼球运动的协调一致，失去两眼眼位的平衡关系。父母或上代有这些变异和缺陷，其子女也可能继承下来。如内直肌附着处有异常，就会妨碍眼球运动而形成内斜视。
